隨著機房的不斷發展，機房建設的一些問題也逐漸顯露出來。

1、機房系統建設的投資及運行維護

機房系統的設計方案是否合理、優化、實用，決定了前期投資的經濟性。因此，機房的總體方案的確定是很重要的，這取決于設計的理念和技術水平。

建設方一般對機房前期的建設比較慎重，要選擇有技術實力的設計單位和技術人員進行機房的設計和施工，以保證機房方案的經濟實用和機房的施工質量。

但是，機房的投資，除了設施建設的投資外，還需要考慮到機房運行后的運行費用的投入，這一點往往是在項目規劃時被忽視的。機房里除了擺放的計算機、網絡設備外，還有許多保證機房環境的設備：如UPS電源設備、空調新風設備、配電設備、安防設備、其它控制設備及弱電設備。

為了保證這些設備日常的使用，需要花費不少的人力和財力，這些費用每天每月都要支出，直接關系到機房后期運行維護費用的投入，而且機房的運行管理是否科學、嚴格，又直接影響到設備的使用壽命，好的機房管理可以延長這些設備的使用壽命，從而影響到投資的使用周期和回報。這在工程實例中比比皆是，有的單位運行維護好，費用低，使用年限長，有的單位運行維護差，費用投入高，使用年限短。

2、機房頂面防水的重要性

現在機房里擺放著大量的精密、貴重的計算機、網絡設備等。一般的信息中心里的設備價值都在幾百萬元或幾千萬元，有的甚至幾億元，一旦有漏水事故發生，就會給用戶造成設備損壞和信息丟失，帶來很大、甚至無可挽回的經濟損失。

機房的防水往往只注重遠離水源和機房內的有水設備的防水，卻忽略了機房所在樓層上部區域的防水。因此，在計算機房系統工程的選址時，要求機房要遠離水源，同時，在機房的總體設計時，要考慮到機房頂面的防水問題。

現在的辦公大樓內都有消防報警滅火系統，在規范中對機房的消防滅火系統要求滅火劑采用氣體滅火劑，就是為機房的防水要求考慮的。

機房選址一般在大樓的中間層，而大樓機房外的樓層和房間一般都為水噴淋滅火，機房上部樓層的水噴淋滅火系統對機房的安全留下很大的隱患，一旦有火情發生，水噴淋系統啟動，水就會滲漏到機房內，威脅機房的安全。因此，在機房的選址時要充分考慮防水的安全問題，同時，在機房頂面的樓層相應的地面要作好防水處理。

3、機房建設概念上存在各種問題

有人將機房建設歸結為機房裝修工程，認為機房建設就是裝修工程;也有人將機房建設歸屬到大樓弱電工程的一個分支專業。

這些問題的存在導致無法抓住機房建設的重點，而將機房建設引人誤區。機房工程是多專業、多學科、技術含量高的綜合工程，在智能建筑工程中處于核心的位置。

因此，必須明確機房工程的重要性才能做好機房建設。

4、機房各系統的均衡問題

機房工程是一個系統工程，是由多個系統協同工作來實現的。但有的用戶無限制地抬高某一系統的可靠性，而忽視了機房整體性能的平衡問題，最終導致機房因其他系統的薄弱而出現問題，導致影響機房系統的穩定運行。

所以不能過分強調某一系統的可靠性，而無限度地抬高整個機房建設的費用。

5、機房的通用性問題

在機房規劃初期，計算機及其他設備還沒有確定，如果不認真作好用戶需求分析，只根據經驗進行組建，那么所進行的規劃設計往往帶有一定的盲目性，無法針對功能需求、設備數量進行相關設計，容易造成難以彌補的缺憾。