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要講磁盤整理，董師傅首先要說明，磁盤碎片只在傳統的碟片式硬盤當中才會有，固態硬盤因為采用的是不同的數據存儲機制，所以不存在磁盤碎片的問題。那么在普通的碟片式硬盤當中，磁盤碎片是怎樣產生的呢?這是因為在普通碟片硬盤當中，文件的存儲方式是分散保存到磁盤的不同地方，而非保存在磁盤連續的簇中。因此可以說，碎片從一開始就產生了，而隨著我們日常應用過程中不斷地修改數據、添加數據，這些文件碎片也就變得越來越多、越來越零散。
那么如何獲得最佳的數據訪問速度呢?最好的情況就是將一個文件的數據集中存儲在磁盤連續的簇當中，這也就是磁盤整理的原理。而磁盤整理的操作就是移動、調整文件的存儲位置，盡量讓每一個文件都可以連續存儲。此外，一些優秀的碎片整理程序還可能嘗試進一步的優化，例如，將所有應用程序以“靠近”磁盤中操作系統存放位置的方式放置，從而把加載應用程序時的文件讀取次數減至最少。
你也許會說，慢就慢唄，反正不整理也不會有什么問題。是的，磁盤碎片一般不會引起系統問題，但磁盤碎片過多會使系統在讀取文件的時候花費更多的尋找(讀取)時間，也就降低了系統性能。特別是那些用的比較久、存儲了很多數據的硬盤，就更是如此。圖中就是在整理磁盤前后磁盤讀取數據的速率對比，可以明顯看到，在讀取磁盤碎片嚴重的數據時，速率最低，整理前后差距也最大，達到5MB/s。而在進行磁盤整理后，數據讀取得快了，系統運行自然也就快了，這也是為什么董師傅讓那位讀者整理磁盤試試看的原因。
當然，你也許會說：“這點速度不算啥，我的電腦配置好，根本感覺不到。”但是你要知道，過多的磁盤碎片將產生更多的讀寫操作，而過多、過于頻繁的讀寫操作也會影響硬盤的使用壽命，甚至造成存儲文件丟失!如果某一天你的硬盤一命嗚呼，那個損失可就大了!
最后，還要說幾點磁盤整理過程中的陋習。首先，磁盤整理要盡量在系統空閑的時候進行，且整理的時候不要進行任何的操作，這樣才能有最好的效果。其次，磁盤整理并不是越頻繁越好，正確的方法應該是在磁盤整理前先進行磁盤分析，確定需要整理時再進行整理。最后，為了讓磁盤整理可以更好地運行，你的磁盤每一個分區都要留有足夠的剩余空間，以便在磁盤整理時有足夠的臨時存儲空間。

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